Na een kwartier kwamen de bezoekers op voorsprong: Gattuso legde aan en een deviatie van het hoofd van Doni zorgde ervoor dat doelman Coppola kansloos was, 0-1. Kort voor de pauze stelde Atalanta orde op zaken: Langella dreigde een paar keer te schieten en vuurde uiteindelijk in doel, voorbij Kalac: 1-1.
Een misverstand tussen Kaladze en Kalac lag aan de basis van de nederlaag: Inzaghi profiteerde en Tissone kon in een leeg doel besluiten, 2-1 in de 68e minuut. Ondanks een hels slotoffensief kon Milan geen gaatje meer vinden in de thuisafweer.